ومنذ صدور القرار الجمهورى بتشكيل الجهاز التنفيذى للهيئة، وتحول العمل داخلها إلى ما يشبه "خلية النحل"، حيث تجتمع الهيئة بكامل تشكيلها وكذا الجهاز التنفيذى لها بشكل يومى، للانتهاء من جميع القرارات الإدارية الخاصة بالانتخاب التكميلى، والتى من بينها تشكيل لجان فرعية تتولى مهمة مراجعة القيد فى قاعدة بيانات الناخبين، وأخرى لتلقى طلبات الترشح برئاسة رئيس محكمة سوهاج الابتدائية، وثالثة لفحص هذه الطلبات.
وتمارس الهيئة الوطنية للانتخابات عملها، من المقر السابق للجنة العليا للانتخابات بمصر الجديدة، بشكل مؤقت لحين أن تتسلم المقر الدائم لها، بعد صدور قرار بتحديده من قبل مجلس الوزراء، والمتوقع أن تنتقل إليه قريبا.
