ويمنح المشروع المُقدم من الحكومة 10 مزايا وتسهيلات خاصة بالفرع والمؤسسة الجامعية، وهى:
1- أن يعمل الفرع فى إطار من الاستقلال والحرية الأكاديمية والمؤسسية.
2- تمتع الفرع والمؤسسة الجامعية بكافة ضمانات وحوافز الاستثمار الواردة بأحكام قانون الاستثمار رقم (72) لسنة 2017.
3- حرص أجهزة الدولة بمنح الفرع التسهيلات والمزايا والتصاريح والتراخيص اللازمة لبدء نشاطه.
4- تشجيع الجهات الحكومية والخاصة على التعاقد مع الفرع لتسهيل مهامه.
5- توفير التسهيلات الإدارية المتطلبة للفرع والتى تمكنه من إنجاز معاملاته الرسمية.
6- أن توفر الدولة للفرع على نفقته الخاصة، الأرض المناسبة من حيث الموقع والمساحة لإنشاء مبانيه.
7- تسهيل الإجراءات اللازمة لمعادلة الدرجات العلمية التى يمنحها الفرع بتلك التى تمنحها الجامعات المصرية.
8- يجوز للفرع تقديم برامج تعليمية وخدمات ثقافية، وبرامج تعليم مستمر، لا يُمنح عنها درجات علمية.
9- يدير الفرع أمواله بنفسه، ويحدد مصروفاته الدراسية.
10- يجوز للفرع استغلال نتائج المشروعات البحثية، وفقًا لما تقرره القوانين للجامعات المصرية.